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Stage Biostatistiques - Analyse intégrative multi OMICs


Publiée le
28 oct.2019
Durée

6 mois

Référence

JNBE_20MVD_JG_BMK

Rémunération

Selon le profil

Localisation

Suresnes

Date de début

mars 2020


Description du poste

Analyse intégrative multi OMICs pour comprendre les mécanismes physiopathologiques de la NASH

Le projet RHU QUID-NASH vise à valider l’hypothèse que des biomarqueurs non invasifs composites (combinant des approches innovantes d’imagerie et de biologie), i) permettront d’établir le diagnostic de maladie métabolique du foie et de stéato-hépatite (nonalcoholic steatohepatitis NASH) sans utiliser de biopsie et d’évaluer leur sévérité ; et ii) permettront de mieux comprendre les mécanismes physiopathologiques de cette affection et de développer de nouvelles approches thérapeutiques.

Dans ce contexte, une première étude préclinique est réalisée sur un modèle murin. De nombreux biomarqueurs seront mesurés comprenant de la métabolomique, lipidomique, transcripomique, cytométrie en flux et de l’imagerie. Dans ce contexte de plusieurs ensembles de données OMICs à analyser conjointement, de nouvelles méthodologies statistiques ont été proposées telle que la block PLSDA.

L’objectif de ce stage, dans une équipe de biostatisticiens spécialistes des biomarqueurs, est d’appliquer ces méthodes d’analyses intégratives sur la première étude préclinique du projet QUID-NASH. Les résultats et leurs interprétations pourront être présentés aux acteurs du projet.

Missions

  • Revue de littérature sur les analyses supervisées intégratives multi-OMICs
  • Familiarisation avec la base données préclinique QUID et la nature des marqueurs mesurées
  • Comparaisons des méthodes intégratives sur les données précliniques QUID et interprétations des résultats

Profil recherché

Étudiant(e) en école d’ingénieur en statistique (ENSAI, ISUP, …).

Étudiant(e) en master 2 de biostatistiques, statistiques appliquées ou équivalent.

Des compétences en langage R et un intérêt pour les sciences de la vie sont nécessaires.

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